A. Arti Bentuk
1. Bentuk luar : Bulat (lingkaran) menunjukkan kebulatan YSKI untuk membantu pemerintah dan masyarakat, dalam bidang pendidikan dan pelayanan.
2. Wadah (tempat). Terdiri dari 3 bagian yang menyatu menggambarkan 3 gereja pendiri (Gereja Kristen Indonesia-Gereja Isa Almasih-Gereja Gereformeerd)
3. Buku sebagai lambang ilmu pengetahuan (mencerdaskan kehidupan bangsa)
4. Bangunan Joglo menunjukkan identitas Jawa Tengah
5. Penyangga Joglo (5 bagian) menunjukan Pancasila
6. Obor (Pelita) mempunyai lidah api 7 buah yang melambangkan awalnya YSKI mempunyai 7 unit sekolah
7. Salib sebagai identitas Kristen
8. Styleren Burung Merpati, dengan sayap melingkar yang menggambarkan kasih suci yang tidak ada habisnya, tak berpangkal tak berakhir, yang menaungi segala kegiatan YSKI

B. ARTI WARNA

1. Putih : Suci
2. Biru : Kesetiaan / keabadian
3. Kuning : Siap / Sedia
4. Merah : Semangat

C. KESIMPULAN ARTI LAMBANG
Kebulatan YSKI untuk melaksanakan Misi Kristus / Pendidikan Nasional, yang berdasar pada persekutuan-kesakian & pelayanan